RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477939.1

TRA2B-211, Transcript of transformer 2 beta homolog, humanhuman

TSL 2

Gene TRA2B, Length 530 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2B-211ENST00000477939 IRF1P10914 325 aa5.85□□□□□ -1.47
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TRA2B-211ENST00000477939 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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TRA2B-211ENST00000477939 H3BNX3 289 aa5.84□□□□□ -1.47
TRA2B-211ENST00000477939 TAF4O00268 1085 aa5.84□□□□□ -1.47
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