RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 RAD51BO15315 384 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ATG13O75143 517 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 EBLN1P0CF75 366 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 UROSP10746 265 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CHRNB1P11230 501 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ADPRHP54922 357 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DLG3Q92796 817 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SGPP1Q9BX95 441 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ALG9Q9H6U8 611 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NT5DC2Q9H857 520 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CDC7O00311 574 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FFAR2O15552 330 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RASSF9O75901 435 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CPOXP36551 454 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GMPRP36959 345 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 HSD17B2P37059 387 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ABCG1P45844 678 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RAP1GDS1P52306 607 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 METAP1P53582 386 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CLCQ05315 142 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FGL2Q14314 439 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CYP2A13Q16696 494 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 AAK1Q2M2I8 961 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 Q6ZVL8 140 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPSM1Q86YR5 675 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NPHS2Q9NP85 383 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FAM50BQ9Y247 325 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 APBB3O95704 486 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 OXTRP30559 389 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PFN3P60673 137 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 YPEL5P62699 121 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SH3BP2P78314 561 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CDK3Q00526 305 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TDGQ13569 410 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC32Q14392 662 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 FXNQ16595 210 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ACCSLQ4AC99 568 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 HORMAD1Q86X24 394 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MAPK15Q8TD08 544 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 AP2M1Q96CW1 435 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 PNPOQ9NVS9 261 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RNF112Q9ULX5 631 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DMTF1Q9Y222 760 aa6.32□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.31□□□□□ -1.4
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PRKCI-202ENST00000476635 TM7SF2O76062 418 aa6.31□□□□□ -1.4
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