RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 KATNA1O75449 491 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SLC22A3O75751 556 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 HMOX2P30519 316 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CAMK1Q14012 370 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 RCAN2Q14206 197 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRE1Q14246 886 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 GRAMD1BQ3KR37 738 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 Q6ZSR9 355 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 FRS2Q8WU20 508 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 C1orf50Q9BV19 199 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CD84Q9UIB8 345 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.87■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PP18 115 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TTC34A8MYJ7 566 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 LEFTY1O75610 366 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 C8BP07358 591 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 VIPR1P32241 457 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 HTR6P50406 440 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SPRED2Q7Z698 418 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 STAMBPO95630 424 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 NFKBIAP25963 317 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 AKT1P31749 480 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CCR7P32248 378 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 AQP4P55087 323 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 FOXM1Q08050 763 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SFRP1Q8N474 314 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 LRCH3Q96II8 777 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 EBF3Q9H4W6 596 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SUN2Q9UH99 717 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.86■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 K7EPI3 171 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 WEE1P30291 646 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 UFM1P61960 85 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ARSIQ5FYB1 569 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC58Q96CX6 371 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TEX37Q96LM6 180 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DPP7Q9UHL4 492 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 FXYD1O00168 92 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 NME4O00746 187 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 PER2O15055 1255 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ANXA5P08758 320 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 AOAHP28039 575 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 GDF5P43026 501 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 RHDQ02161 417 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DHCR24Q15392 516 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 NR6A1Q15406 480 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DET1Q7L5Y6 550 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 SMOXQ9NWM0 555 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 IL36AQ9UHA7 158 aa16.85■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TSPAN11A1L157 253 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC154A6NI56 674 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 EPB42P16452 691 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 MSH3P20585 1137 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 PIK3CGP48736 1102 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DCDC1P59894 354 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 EMX2Q04743 252 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 DHFR2Q86XF0 187 aa16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
FAAP20-211ENST00000469733 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms