RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CPT1B	Q92523	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RILP	Q96NA2	401 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983		A0A0J9YVX5	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MEI4	A8MW99	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DSCR3	O14972	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	VILL	O15195	856 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM63A	O94886	807 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CLPTM1	O96005	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AR	P10275	920 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MYL4	P12829	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PRF1	P14222	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PEX2	P28328	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PRDX6	P30041	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINB6	P35237	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CPOX	P36551	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FDFT1	P37268	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CDKN2B	P42772	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINB8	P50452	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	COPA	P53621	1224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	EPHB1	P54762	984 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AQP5	P55064	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AQP4	P55087	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PDE1B	Q01064	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FOLH1	Q04609	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GAD2	Q05329	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BTK	Q06187	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	STX3	Q13277	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIP10	Q15642	601 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARC	Q7LC44	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.4 ms