RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442419.1

SNHG11-210, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 3

Gene SNHG11, Length 741 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-210ENST00000442419 SMIM23A6NLE4 172 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 PFDN6O15212 129 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 PIAS2O75928 621 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 CD9P21926 228 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 ZNF398Q8TD17 642 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 U3KQA8 63 aa11.5□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 A8MX80 341 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 FFAR2O15552 330 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 HAUS5O94927 633 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 PRAMEF1O95521 474 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ELFN1P0C7U0 828 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 ITGA9Q13797 1035 aa11.49□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 Q6ZVL8 140 aa11.49□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 IFI44Q8TCB0 444 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ASB12Q8WXK4 309 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 LPGAT1Q92604 370 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ULK4Q96C45 1275 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 VPS35Q96QK1 796 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 TTC1Q99614 292 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ABCG8Q9H221 673 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 PREBQ9HCU5 417 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 MKS1Q9NXB0 559 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 OGFRQ9NZT2 677 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 TBK1Q9UHD2 729 aa11.49□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.49□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 NBASA2RRP1 2371 aa11.48□□□□□ -0.57
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SNHG11-210ENST00000442419 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 SCAMP1O15126 338 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 EFSO43281 561 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 RFPL1O75677 317 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 SLC4A1P02730 911 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 MT-ND3P03897 115 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 PYGLP06737 847 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 THEGLP0DJG4 465 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 KRT15P19012 456 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ACRV1P26436 265 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 TEAD1P28347 426 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 CCNFP41002 786 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 NFKB2Q00653 900 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 POU4F1Q01851 419 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.48□□□□□ -0.57
SNHG11-210ENST00000442419 MROH9Q5TGP6 573 aa11.48□□□□□ -0.57
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