RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 KCNH5Q8NCM2 988 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 EXD1Q8NHP7 514 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SMPDL3BQ92485 455 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 HDAC11Q96DB2 347 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 LYZL4Q96KX0 146 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 FAM81BQ96LP2 452 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 NEURL2Q9BR09 285 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ABHD6Q9BV23 337 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A23Q9BV35 468 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 CD93Q9NPY3 652 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL1Q9NR64 748 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MALT1Q9UDY8 824 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TUBE1Q9UJT0 475 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 YIPF1Q9Y548 306 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 C5orf60A6NFR6 353 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 C15orf62A8K5M9 175 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 INSIG1O15503 277 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 XRCC3O43542 346 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 OR10H2O60403 315 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 GPR137BO60478 399 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TSPAN1O60635 241 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 DIAPH2O60879 1101 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 BMP10O95393 424 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 LDLRP01130 860 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 DANCRP0C864 163 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 CDH1P12830 882 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G2AP14555 144 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PTAFRP25105 342 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TNFRSF8P28908 595 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 AHRP35869 848 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ART1P52961 327 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ZXDBP98169 803 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TFCP2Q12800 502 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 HSPB3Q12988 150 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G7Q13093 441 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PTPRCAPQ14761 206 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 KIF19Q2TAC6 998 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 VWC2Q2TAL6 325 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL26Q53HC5 615 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 GRTP1Q5TC63 336 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf82Q7Z2V1 217 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ARMC9Q7Z3E5 817 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 KIF18AQ8NI77 898 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA4DQ92854 862 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MTERF3Q96E29 417 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SPDL1Q96EA4 605 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 MED30Q96HR3 178 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TTC14Q96N46 770 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 NUP85Q9BW27 656 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 OPA3Q9H6K4 179 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 OSER1Q9NX31 292 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0G2JNG1 304 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 TRIM77I1YAP6 450 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRC-205ENST00000391970 PDE9AO76083 593 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 OR2T7P0C7T2 308 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 CTAGE8P0CG41 777 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SNHG28P0DPA3 235 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 SCG2P13521 617 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF23P17027 643 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 ERCC2P18074 760 aa2.98□□□□□ -1.93
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