RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 SNAP29O95721 258 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 UROSP10746 265 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 HLCSP50747 726 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 VEPH1Q14D04 833 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ9Q92806 393 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ALG14Q96F25 216 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 BDH2Q9BUT1 245 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM45AQ9NWC5 275 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM9Q9P0T7 183 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 GFRA2O00451 464 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ESRRBO95718 433 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 IMPDH2P12268 514 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 CTPS1P17812 591 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 IL2P60568 153 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 UFM1P61960 85 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 NANOGP8Q6NSW7 305 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 BIRC7Q96CA5 298 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB118Q96PH6 123 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 NANOGQ9H9S0 305 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF711Q9Y462 761 aa23.53■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PRRG1O14668 218 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX2O60749 519 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 MLYCDO95822 493 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ALPIP09923 528 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 VWCEQ96DN2 955 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM74Q96NL1 305 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 P2RY12Q9H244 342 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SUN2Q9UH99 717 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PFDN6O15212 129 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PTGER3P43115 390 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ERVK-8P63133 956 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 EMX2Q04743 252 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNDC8Q6A555 127 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 OR6K2Q8NGY2 324 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 BORCS5Q969J3 196 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS50Q96JG6 964 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 CHID1Q9BWS9 393 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC3Q9BY71 257 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D23Q9NUY8 699 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 OBSL1O75147 1896 aa23.52■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM234BA2RU67 622 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CPNE6O95741 557 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 HRH2P25021 359 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP3CCP48454 512 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CLCN7P51798 805 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 GPSM1Q86YR5 675 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC16Q8NEE8 873 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 HGH1Q9BTY7 390 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TM6SF2Q9BZW4 377 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SLAMF8Q9P0V8 285 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PPW3 197 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 E5RI56 91 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 FKTNO75072 461 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CA5AP35218 305 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP2P42575 452 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB15P59190 212 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB33AQ14088 237 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 Q6ZNB5 142 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 APCDD1Q8J025 514 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D15Q8TC07 691 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPHS2Q99611 448 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PKP3Q9Y446 797 aa23.51■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 LATS1O95835 1130 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ALBP02768 609 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ESR1P03372 595 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 HMGCLP35914 325 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH18Q13634 790 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 FGD3Q5JSP0 725 aa23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms