RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNASE1P24855 282 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABRA5P31644 462 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK3Q00526 305 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIR2DS5Q14953 304 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLC3Q6P597 504 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSG4Q86SJ6 1040 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADIPOR2Q86V24 386 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTOV1Q86YD1 416 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC191Q8NCU4 936 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10S1Q8NGN2 331 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR13A1Q8NGR1 328 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C1Q96RD1 312 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PKP4Q99569 1192 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF556Q9HAH1 456 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDE1Q9NZC3 331 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 WWOXQ9NZC7 414 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAAR2Q9P1P5 351 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK26Q9P289 416 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROCRQ9UNN8 238 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF711Q9Y462 761 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCN5AQ14524 2016 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTAGE9A4FU28 777 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf60A6NFR6 353 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2CO00762 179 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 XRCC3O43542 346 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN1O60635 241 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED24O75448 989 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMD10O75832 226 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCNT3O95395 438 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFAP2AP05549 437 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTAGE8P0CG41 777 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CKMT2P17540 419 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDH13P55290 713 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFAP5Q13361 173 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALCAMQ13740 583 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LETM2Q2VYF4 491 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACCSLQ4AC99 568 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBWD6Q4V339 395 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBWD3Q5JTY5 395 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf139Q6ZV77 190 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTAGE4Q8IX94 777 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC24A4Q8NFF2 622 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEKT4Q8WW24 435 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD6Q9BV23 337 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D17Q9HA65 648 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 EQTNQ9NQ60 294 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC38A7Q9NVC3 462 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms