RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF623O75123 536 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SCELO95171 688 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ALOX12P18054 663 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR1BP42025 376 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR1AP61163 376 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 BNIP1Q12981 228 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SERINC3Q13530 473 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RTL4Q6ZR62 310 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HPS6Q86YV9 775 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM13CQ8NE31 585 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IRGMA1A4Y4 181 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TCF4P15884 667 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ACVRL1P37023 503 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK10P53779 464 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RALGDSQ12967 914 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HBEGFQ99075 208 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNW1P05000 195 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF30P17039 623 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 AP1S2P56377 157 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LPGAT1Q92604 370 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IGSF21Q96ID5 467 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 J3KR12 359 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TIPRLO75663 272 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 BNC1Q01954 994 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OGDHQ02218 1023 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GHRHRQ02643 423 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LIX1Q8N485 282 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DNASE1L2Q92874 299 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HNMTP50135 292 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TTLQ8NG68 377 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIB2Q92519 343 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A9O60656 530 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RB1P06400 928 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GPIP06744 558 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GALTP07902 379 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A6P19224 532 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A1P22309 533 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A4P22310 534 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A3P35503 534 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ISLR2Q6UXK2 745 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FITM2Q8N6M3 262 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG2Q9H553 416 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LRP6O75581 1613 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP12AP54707 1039 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TAB1Q15750 504 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL12Q53G59 568 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZVU0 165 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A14Q9HCY8 104 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF487B1APH4 448 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A2O15244 555 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GNSP15586 552 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 VIPR1P32241 457 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FOLH1Q04609 750 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ11Q14654 390 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MYLK3Q32MK0 819 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 REP15Q6BDI9 236 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms