RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf66Q96MD2 445 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCM2Q9BSQ5 444 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPH1Q9BZG8 443 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL22Q9GZX6 179 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TREX1Q9NSU2 369 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCIAD1Q9NX40 245 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEU2Q9Y3R4 380 aa19.12■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLK10O43240 276 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD34CP0C6C1 535 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMD1P17707 334 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT1P26572 445 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TERF1P54274 439 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK16Q00536 496 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA3AQ14563 771 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD22Q5VYY1 191 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC8BQ6P9F7 803 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMPERQ8N8U9 685 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4L1Q8NH43 312 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGSM3Q96HU1 749 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf72Q96LT7 481 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNT4Q9C0J1 378 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52A5Q9H2C5 316 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS37BQ9H9H4 285 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYBUQ9NX95 663 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBEAQ8NFP9 2946 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB7A8K855 629 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4E171 279 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP3B1O00203 1094 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1I1O60431 355 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM63AO94886 807 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN7P41732 249 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPY2RP49146 381 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEP78395 509 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM129CQ86XR2 697 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6P1Q8NGX9 317 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPT1BQ92523 772 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ART4Q93070 314 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGM7Q96PF1 710 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRORYQ9H606 182 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 BFARQ9NZS9 450 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGSF10Q6WRI0 2623 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTM1P09488 218 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMBRP28336 390 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PREPP48147 710 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNTAP49354 379 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1CAP62136 330 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTM4Q03013 218 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCL1Q15111 1095 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFAND4Q86XD8 727 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAAR9Q96RI9 348 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIFC1Q9BW19 673 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDA1Q9BW61 102 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB33BQ9H082 229 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 QSOX1O00391 747 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPCP11150 499 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCP1P17987 556 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD82P27701 267 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDHA2P29803 388 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG11P61952 73 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPA4Q13156 261 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSE1Q14687 1217 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGIF1Q15583 401 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM164Q5U3C3 297 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CERS6Q6ZMG9 384 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS42Q7Z5A4 293 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATSPERZQ9NTU4 200 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A1Q9NY26 324 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA6Q9UF33 1036 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX13Q9UN79 622 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 AVILO75366 819 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 FTH1P02794 183 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARNTP27540 789 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS3P57727 454 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB15P59190 212 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MC2RQ01718 297 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 BROXQ5VW32 411 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKS6Q68DC2 871 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms