RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM135Q86UB9 458 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ALG2Q9H553 416 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 GPIP06744 558 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 GSSP48637 474 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 PCLAFQ15004 111 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 PDGFRLQ15198 375 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 CHRNA6Q15825 494 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 RAB6CQ53S08 254 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM74Q86UV6 250 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM73Q86UV7 250 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF607Q96SK3 696 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 DERL2Q9GZP9 239 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PRKCGP05129 697 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IL6P05231 212 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HNMTP50135 292 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 STEAP4Q687X5 459 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SFRP1Q8N474 314 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MAFFQ9ULX9 164 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 KCTD3Q9Y597 815 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 A0A0D9SEW6 157 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ELOVL7A1L3X0 281 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GSAPA4D1B5 854 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 KLHL33A6NCF5 533 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GJB5O95377 273 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CCNFP41002 786 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CDC42P60953 191 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ARSIQ5FYB1 569 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 AK5Q9Y6K8 562 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IQCF5A8MTL0 148 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LEFTY2O00292 366 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGEF9O43307 516 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TIPRLO75663 272 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CBSLP0DN79 551 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CBSP35520 551 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 AP1S2P56377 157 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RTP2Q5QGT7 225 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IGSF8Q969P0 613 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 OTUB2Q96DC9 234 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 POMPQ9Y244 141 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PIPSLA2A3N6 862 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SOCS5O75159 536 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 IMPDH2P12268 514 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 VIPR1P32241 457 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 KLHL35Q6PF15 583 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 BCORQ6W2J9 1755 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LATS1O95835 1130 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FSHRP23945 695 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LPCAT4Q643R3 524 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZVU0 165 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 NAT14Q8WUY8 206 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1191Q96A73 305 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RANBP9Q96S59 729 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM165Q9HC07 324 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 FAM234BA2RU67 622 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PI15O43692 258 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 CENPAP49450 140 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 LIX1Q8N485 282 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 HBEGFQ99075 208 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-202ENST00000320031 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms