RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 HERVK_113P63132 956 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 IL1RL1Q01638 556 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 IL18R1Q13478 541 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GPR50Q13585 617 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 RCAN2Q14206 197 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GBX1Q14549 363 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NKG7Q16617 165 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 XRRA1Q6P2D8 792 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ISCA2Q86U28 154 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 RAB43Q86YS6 212 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 OR8H2Q8N162 312 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SLC38A4Q969I6 547 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PYCR2Q96C36 320 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 RNF170Q96K19 258 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PPM1MQ96MI6 270 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GON7Q9BXV9 100 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 C12orf10Q9HB07 376 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 POLG2Q9UHN1 485 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 OTOFQ9HC10 1997 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NRCAMQ92823 1304 aa5.65□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 FAM72CH0Y354 149 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 ARHGAP33O14559 1287 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 SHOXO15266 292 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 DCTP40126 519 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MTPNP58546 118 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 CXCR4P61073 352 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 PLIN5Q00G26 463 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 INCA1Q0VD86 236 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 GALNT3Q14435 633 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 PARP15Q460N3 678 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 GPR158Q5T848 1215 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 OSTM1Q86WC4 334 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 FAM72BQ86X60 149 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 DEFB106AQ8N104 65 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 EID3Q8N140 333 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 APPL2Q8NEU8 664 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 AFG1LQ8WV93 481 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 UBE2FQ969M7 185 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 TEKT5Q96M29 485 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 BEX2Q9BXY8 128 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.65□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.64□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 OR2A25A4D2G3 310 aa5.64□□□□□ -1.51
ZNF559-201ENST00000317221 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms