RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.91□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 ZFATQ9P243 1243 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CACNA1AO00555 2505 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PQM1 296 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 KCNJ13O60928 360 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 DKK1O94907 266 aa8.88□□□□□ -0.99
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