RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB14O43829 449 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 E9PI62 339 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ARL14Q8N4G2 192 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR6C74A6NCV1 312 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CFL1P23528 166 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RENBPP51606 427 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LIMK2P53671 638 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087WZ62 844 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MUTP22033 750 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB35Q15286 201 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ALG9Q9H6U8 611 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PSMD10O75832 226 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXO21O94952 628 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 COQ8BQ96D53 544 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DDIT4Q9NX09 232 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 H7C1Q1 480 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ARPC2O15144 300 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FAAP100Q0VG06 881 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MED31Q9Y3C7 131 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SDK2Q58EX2 2172 aa11.05□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FPGTO14772 594 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC15A1P46059 708 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACVR2BQ13705 512 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MAPK14Q16539 360 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 USP20Q9Y2K6 914 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LCKP06239 509 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ANXA3P12429 323 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 COTL1Q14019 142 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 XKR4Q5GH76 650 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NPAS2Q99743 824 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 EBF3Q9H4W6 596 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM10O14672 748 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FGL1Q08830 312 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MTRRQ9UBK8 725 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BANF1O75531 89 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GH1P01241 217 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 TFPTP0C1Z6 253 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CMPK1P30085 196 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SSTR1P30872 391 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 AQP4P55087 323 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 BEND4Q6ZU67 534 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 MBOAT7Q96N66 472 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PANX1Q96RD7 426 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OR7A17O14581 309 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SGCEO43556 437 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP2F1P24903 491 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 KLRK1P26718 216 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CTHP32929 405 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SBK1Q52WX2 424 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CD302Q8IX05 232 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 SCN2BO60939 215 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 FABP3P05413 133 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 GRB10Q13322 594 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 LIPMQ5VYY2 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF878C9JN71 531 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 OGTO15294 1046 aa11.04□□□□□ -0.64
HDGFL3-201ENST00000299633 ACVR2AP27037 513 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms