RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CHST9Q7L1S5 443 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DAW1Q8N136 415 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR1BQ92637 280 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MSRAQ9UJ68 235 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ITPKBP27987 946 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OR52J3Q8NH60 311 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN2DO15399 1336 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IQCF5A8MTL0 148 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NCK1P16333 377 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SEPHS1P49903 392 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV3Q8NET8 790 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MYOCQ99972 504 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS7Q9Y394 339 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SHPRHQ149N8 1683 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRJQ12913 1337 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 E7ENX8 843 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 S100A9P06702 114 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CDH12P55289 794 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-8P63133 956 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF563Q8TA94 476 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC3Q9BY71 257 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD19C9JJ37 291 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NFATC1O95644 943 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF12P17014 697 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IMPDH1P20839 514 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AG2A6NM03 316 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HBEGFQ99075 208 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TP73O15350 636 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CD247P20963 164 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CCR10P46092 362 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HERVK_113P63132 956 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ECT2LQ008S8 904 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RAPSNQ13702 412 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CKLFQ9UBR5 152 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH4A1P30038 563 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ABATP80404 500 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PIGXQ8TBF5 258 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DSN1Q9H410 356 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31D3P0C874 917 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ARFIP1P53367 373 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD46Q86W74 232 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF347Q96SE7 839 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C3P01024 1663 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SATL1Q86VE3 508 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf48Q96LL4 319 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.85■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MATN2O00339 956 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KLF11O14901 512 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 GNAZP19086 355 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PRR5P85299 388 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PJA1Q8NG27 643 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE1L2Q92874 299 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB3O15480 346 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A6Q92581 669 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ASB9Q96DX5 294 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf42Q96LP6 360 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PHF12Q96QT6 1004 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB9Q9NP78 766 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms