RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 MIPEPQ99797 713 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SMOQ99835 787 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 RFC2P35250 354 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 NOVP48745 357 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 ECT2LQ008S8 904 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 TLE2Q04725 743 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 ITGADQ13349 1161 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 UGT1A5P35504 534 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 UBXN11Q5T124 520 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.09■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 PLK4O00444 970 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 SLC51AQ86UW1 340 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 USP29Q9HBJ7 922 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 WASP42768 502 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 HDDC2Q7Z4H3 204 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 PCYT2Q99447 389 aa20.08■□□□□ 0.81
LRIG1-201ENST00000273261 TNFRSF11BO00300 401 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 BCKDKO14874 412 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 INSL6Q9Y581 213 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FFAR2O15552 330 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MPZL2O60487 215 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 HM13Q8TCT9 377 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 WWP2O00308 870 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CAPGP40121 348 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC15Q8TF66 581 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 HERVK_113Q902F9 699 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 WNT9AO14904 365 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GRIA1P42261 906 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AP1S2P56377 157 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PRR5P85299 388 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC18A2Q05940 514 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PARGQ86W56 976 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TMC8Q8IU68 726 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LCN9Q8WX39 176 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MCM8Q9UJA3 840 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 U3KQV3 271 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IQCF5A8MTL0 148 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CYP4B1P13584 511 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PRKCHP24723 683 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AQP1P29972 269 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SERINC3Q13530 473 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GPR22Q99680 433 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IRF9Q00978 393 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FSTL1Q12841 308 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 DLK2Q6UY11 383 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 BEND5Q7L4P6 421 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 POMPQ9Y244 141 aa20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CBSLP0DN79 551 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EDNRBP24530 442 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CBSP35520 551 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IL12RB1P42701 662 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RPS6KA3P51812 740 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF846Q147U1 533 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms