RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 FGBP02675 491 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RPN2P04844 631 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 HLA-EP13747 358 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 KCNE1P15382 129 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ITGAXP20702 1163 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PTNP21246 168 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 GLDCP23378 1020 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 NTSP30990 170 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MTAPQ13126 283 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MTA1Q13330 715 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 LAPTM5Q13571 262 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 LPIN1Q14693 890 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PCLAFQ15004 111 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ARSIQ5FYB1 569 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZVL8 140 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SLC34A3Q8N130 599 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CNTD1Q8N815 330 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 POC5Q8NA72 575 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 IGSF8Q969P0 613 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 REPS1Q96D71 796 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 GDAP2Q9NXN4 497 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 EHD3Q9NZN3 535 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SRRDQ9UH36 339 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SNTNA6NMZ2 147 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 K7ERQ8 282 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 KRT75O95678 551 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 UROSP10746 265 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CCNA2P20248 432 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PRKACGP22612 351 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ARSDP51689 593 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 UFM1P61960 85 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 BNIP2Q12982 314 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 BLMHQ13867 455 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB6Q15916 424 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 GPR153Q6NV75 609 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 GULP1Q9UBP9 304 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 FBXW2Q9UKT8 454 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RGPD5Q99666 1765 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MTMR11A4FU01 709 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 TRIM24O15164 1050 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 OR1F1O43749 312 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ATG13O75143 517 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ESR1P03372 595 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 LAG3P18627 525 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 KRT20P35900 424 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 PTGER3P43115 390 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 RPS9P46781 194 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MAPKAPK2P49137 400 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 ZNF132P52740 706 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 MXD1Q05195 221 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-201ENST00000261169 SLC18A2Q05940 514 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms