RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 GPR21Q99679 349 aa24.35■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.35■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.35■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 BTN3A1O00481 513 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 TBX18O95935 607 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 GALTP07902 379 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 MTHFRP42898 656 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 HK3P52790 923 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 IST1P53990 364 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 TBX4P57082 545 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PRKG2Q13237 762 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 ITGADQ13349 1161 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 AQP6Q13520 282 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 RGS21Q2M5E4 152 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 NRBF2Q96F24 287 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa24.34■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 OR6C75A6NL08 312 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 SYCE1LA8MT33 242 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 OR4F21O95013 312 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 MLYCDO95822 493 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 ACVRL1P37023 503 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 MAGEA11P43364 429 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 IL10RBQ08334 325 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 SPCS2Q15005 226 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 AAK1Q2M2I8 961 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 MBOAT4Q96T53 435 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 ACTL8Q9H568 366 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 SMURF2Q9HAU4 748 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 HPS4Q9NQG7 708 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PLXNA3P51805 1871 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 ANXA6P08133 673 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 PIGFQ07326 219 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 CYP2A13Q16696 494 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 FBXL22Q6P050 247 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 CDYL2Q8N8U2 506 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 CDK15Q96Q40 435 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 FAM118AQ9NWS6 357 aa24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LMO2-201ENST00000257818 MTMR11A4FU01 709 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 VNN2O95498 520 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 GGT1P19440 569 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 EFEMP1Q12805 493 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 IMPG1Q17R60 797 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FBXO32Q969P5 355 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CGREF1Q99674 301 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TSPAN12O95859 305 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CDH3P22223 829 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PIGAP37287 484 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 GSTM4Q03013 218 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SERINC3Q13530 473 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NKG7Q16617 165 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MEP1AQ16819 746 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ANKRD34AQ69YU3 496 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OR52B6Q8NGF0 335 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FUNDC2Q9BWH2 189 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RNF208Q9H0X6 261 aa24.32■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 E2F3O00716 465 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HPRP00739 348 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NR4A1P22736 598 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NFKBIAP25963 317 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 IDUAP35475 653 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OPRL1P41146 370 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 DGKQP52824 942 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 C6orf141Q5SZD1 244 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 LAIR2Q6ISS4 152 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 BTLAQ7Z6A9 289 aa24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms