RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237014.7

TTR-201, Transcript of transthyretin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTR, Length 957 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-201ENST00000237014 TMEM63AO94886 807 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TNFSF15O95150 251 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ITGA2BP08514 1039 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CCL4P13236 92 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 MSH3P20585 1137 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ACRV1P26436 265 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ACTN2P35609 894 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 HADHAP40939 763 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRLHRP49683 370 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LIMK2P53671 638 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GFERP55789 205 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CRADDP78560 199 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GPLD1P80108 840 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PDE1BQ01064 536 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GPR18Q14330 331 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SEMA3AQ14563 771 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 KCNJ11Q14654 390 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PHF19Q5T6S3 580 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LCE3BQ5TA77 95 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LINC00523Q86TU6 105 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PIM3Q86V86 326 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 AMZ2Q86W34 360 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RSC1A1Q92681 617 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FGF11Q92914 225 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PBKQ96KB5 322 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TMEM74Q96NL1 305 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RANBP9Q96S59 729 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SLC38A3Q99624 504 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 COPS8Q99627 209 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 POT1Q9NUX5 634 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PDP2Q9P2J9 529 aa7.15□□□□□ -1.26
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TTR-201ENST00000237014 PISDQ9UG56 409 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SNX12Q9UMY4 172 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 HEATR9A2RTY3 570 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 MGAT4DA6NG13 374 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 OR5K4A6NMS3 321 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 C9orf172C9J069 976 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 E7EVH7 732 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 ZSCAN12O43309 604 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 DUX1O43812 170 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 SLC2A4P14672 509 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 TPSB2P20231 275 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 IDSP22304 550 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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TTR-201ENST00000237014 MAGEA6P43360 314 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 MAPK9P45984 424 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 VPS41P49754 854 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 EPHA4P54764 986 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 PPP1CAP62136 330 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 TLE3Q04726 772 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 CACNG1Q06432 222 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 BIRC2Q13490 618 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 TPSAB1Q15661 275 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 RPE65Q16518 533 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 GPR33Q49SQ1 333 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 METRNLQ641Q3 311 aa7.14□□□□□ -1.27
TTR-201ENST00000237014 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.14□□□□□ -1.27
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