RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	IFNW1	P05000	195 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	AOC1	P19801	751 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ULK3	Q6PHR2	472 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	STON2	Q8WXE9	905 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.58	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ACOX3	O15254	700 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	STK16	O75716	305 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	IFNA6	P05013	189 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIA1	P42261	906 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MMP14	P50281	582 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	CEBPG	P53567	150 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TAS2R41	P59536	307 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ISPD	A4D126	451 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	FPGT	O14772	594 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MTA2	O94776	668 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	DNTT	P04053	509 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MAGEA8	P43361	318 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	STT3A	P46977	705 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	NUDT6	P53370	316 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	CSF2	P04141	144 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	HOXD10	P28358	340 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SCNN1G	P51170	649 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM233	B4DJY2	109 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF432	O94892	652 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ITGB1	P05556	798 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	IL7R	P16871	459 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC18A1	P54219	525 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ACAP2	Q15057	778 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GGT5	P36269	586 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TCEA2	Q15560	299 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	GHDC	Q8N2G8	530 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	FNDC8	Q8TC99	324 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	COPS5	Q92905	334 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM200B-223	ENST00000622362	AURKA	O14965	403 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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