RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARF5	P84085	180 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRAF2	Q12933	501 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	RALGDS	Q12967	914 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	NFYC	Q13952	458 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	RCAN2	Q14206	197 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	XKR7	Q5GH72	579 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	LCN8	Q6JVE9	175 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAYN	Q6UX15	382 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKFN1	Q8N957	763 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM169	Q96HH4	297 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF558	Q96NG5	402 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZBTB18	Q99592	522 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		9.09	□□□□□ -0.95
EFTUD2-222	ENST00000592408	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	DHRS12	A0PJE2	317 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC154	A6NI56	674 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CDC7	O00311	574 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	TSPAN3	O60637	253 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	NIPSNAP2	O75323	286 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC22A3	O75751	556 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGLS	O95336	258 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLPTM1	O96005	669 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	MT-CO1	P00395	513 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLKB1	P03952	638 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	LINC00032	P0C843	101 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	UMPS	P11172	480 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAG3	P18627	525 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	DGKA	P23743	735 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFC2	P35250	354 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	HMGCL	P35914	325 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSNK1D	P48730	415 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	BCL2L1	Q07817	233 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	IKBKE	Q14164	716 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMU1	Q2TAY7	513 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	IL23R	Q5VWK5	629 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	KRT80	Q6KB66	452 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTC23L	Q6PF05	361 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SNX20	Q7Z614	316 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYVN1	Q86TM6	617 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPR65	Q8IYL9	337 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC58	Q96CX6	371 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF597	Q96LX8	424 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	CNBD2	Q96M20	576 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	C3orf30	Q96M34	536 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	BIRC8	Q96P09	236 aa		9.08	□□□□□ -0.96
EFTUD2-222	ENST00000592408	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms