RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H423 210 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 BUD23O43709 281 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRG1O75711 98 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 AGFG2O95081 481 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKB1P19838 968 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB4BP68371 445 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC5Q12768 1159 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GPS2Q13227 327 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB2AQ13885 445 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRC6AQ5T6X5 926 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A9Q8NBW4 561 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ING2Q9H160 280 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSS2Q9NR19 701 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 HRASLS2Q9NWW9 162 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNKQ9P0W0 207 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL11P51671 97 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE1BQ01064 536 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 XRCC4Q13426 336 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FHL5Q5TD97 284 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MR1Q95460 341 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1MQ96MI6 270 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 WWP1Q9H0M0 922 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGIRP43119 386 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FNBP1LQ5T0N5 605 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC38Q5VT99 294 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 METRNLQ641Q3 311 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DET1Q7L5Y6 550 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 OOSP2Q86WS3 158 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT14Q8WUY8 206 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST8Q9H2A9 424 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 KCND1Q9NSA2 647 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 EPOP01588 193 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNT1P13805 278 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP25P42331 645 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRCAPQ14761 206 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A5Q15758 541 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN10Q6JVE6 187 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf66Q96MD2 445 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 DEF6Q9H4E7 631 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SMOXQ9NWM0 555 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.598e-14■□□□□ 10.2
CAPNS1-211ENST00000590874 HACD3Q9P035 362 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCE3A1L190 88 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C74A6NCV1 312 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF224P0DH78 156 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LPOP22079 712 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA9Q13797 1035 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LLGL1Q15334 1064 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 IPMKQ8NFU5 416 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM8A1Q9UBU6 413 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PKP3Q9Y446 797 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA7AO75326 666 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 AKT1P31749 480 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN2BP42772 138 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 NR2C2P49116 596 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.99■■□□□ 1.59
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