RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 GLRBP48167 497 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 DPYSL3Q14195 570 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 NOMO1Q15155 1222 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 KCNMB4Q86W47 210 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 LRFN5Q96NI6 719 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TSGA13Q96PP4 275 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SEC16AO15027 2179 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 OR6C74A6NCV1 312 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC53A6NM62 1247 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 VEGFDO43915 354 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A9O60656 530 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A6P19224 532 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A1P22309 533 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A4P22310 534 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 ARL4DP49703 201 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PLCL1Q15111 1095 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZS92 163 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 MRGPREQ86SM8 312 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 KMT5CQ86Y97 462 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 HPS6Q86YV9 775 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 SLC34A3Q8N130 599 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 PQLC3Q8N755 202 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 TEKT4Q8WW24 435 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 C5AR2Q9P296 337 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 BTRCQ9Y297 605 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRS-208ENST00000590509 HCRTR1O43613 425 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ALOX12BO75342 701 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CTSBP07858 339 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SKILP12757 684 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CES1P23141 567 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GSDMDP57764 484 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 KRT81Q14533 505 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NCF4Q15080 339 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PCSK7Q16549 785 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SGSM3Q96HU1 749 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZFHX3Q15911 3703 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 OR2AG2A6NM03 316 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CBSLP0DN79 551 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PVRP15151 417 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CBSP35520 551 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GJC1P36383 396 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 LMAN1P49257 510 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 DMPKQ09013 629 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MYBPC3Q14896 1274 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 HIF1AQ16665 826 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GALNT16Q8N428 558 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CPT1BQ92523 772 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 FATE1Q969F0 183 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 VPS35Q96QK1 796 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 CD180Q99467 661 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 WWP1Q9H0M0 922 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 AMACRQ9UHK6 382 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRS-208ENST00000590509 PRSS44E7EML9 344 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms