RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 GLRA3O75311 464 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TNFRSF21O75509 655 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 BANF1O75531 89 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GJB3O75712 270 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AHSGP02765 367 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SHBGP04278 402 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RPN2P04844 631 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 BRAFP15056 766 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PCSK2P16519 638 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GABRG2P18507 467 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 ARNTP27540 789 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CRHR1P34998 444 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM23P36406 574 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 NUMBP49757 651 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 BLKP51451 505 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IL2P60568 153 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS15P98073 1019 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 XIAPP98170 497 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RALGDSQ12967 914 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RPA4Q13156 261 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 OLIG2Q13516 323 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CHRNA6Q15825 494 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MROH9Q5TGP6 573 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PNCKQ6P2M8 343 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TTC23LQ6PF05 361 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CES3Q6UWW8 571 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRABD2AQ86V40 505 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AVL9Q8NBF6 648 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FLCNQ8NFG4 579 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 LPGAT1Q92604 370 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 INPP5DQ92835 1189 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PMM1Q92871 262 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 FOPNLQ96NB1 174 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 PRRX2Q99811 253 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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SMAD4-210ENST00000590061 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ABCG8Q9H221 673 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 WDR26Q9H7D7 661 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CD248Q9HCU0 757 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM221A6NGB7 291 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 IGLON5A6NGN9 336 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 H3BQF6 201 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 M0R296 226 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AGPSO00116 658 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 EREGO14944 169 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 AURKAO14965 403 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 LATO43561 262 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 RHOBTB1O94844 696 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CDK14O94921 469 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 C1SP09871 688 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A4P14672 509 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 GNSP15586 552 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 TAC1P20366 129 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 NR1D1P20393 614 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 CD72P21854 359 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 ALDH3A1P30838 453 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD4-210ENST00000590061 HOXD12P35452 270 aa7.22□□□□□ -1.25
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