RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 H0Y626 953 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 STX7O15400 261 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 KLK8O60259 260 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TBL1XO60907 577 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS4BO75351 444 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS26AO75436 327 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PKMP14618 531 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TYRP14679 529 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT2P50583 147 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 HACD2Q6Y1H2 254 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CERS6Q6ZMG9 384 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf74Q86VG3 221 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG14Q96F25 216 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 BBS2Q9BXC9 721 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TM4SF5O14894 197 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UBDO15205 165 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SRP72O76094 671 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SUPT7LO94864 414 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 BCKDHBP21953 392 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGER3P43115 390 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAF2Q12933 501 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNIQ14094 377 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTK2BQ14289 1009 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RETSATQ6NUM9 610 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 IRGCQ6NXR0 463 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PIM3Q86V86 326 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ9Q92806 393 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO10Q9UK96 956 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SARDHQ9UL12 918 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN3O60637 253 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A1P02730 911 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ESR1P03372 595 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CISD3P0C7P0 127 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MTHFD2P13995 350 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY2P41231 377 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHB1P54762 984 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ART3Q13508 389 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 BLMHQ13867 455 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP1Q6P2D0 407 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 DLG3Q92796 817 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF21BQ96EK2 531 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MOCOSQ96EN8 888 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 AIM2O14862 343 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 GPC4O75487 556 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNC1P48547 511 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOAP61586 193 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTA3Q16772 222 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGGQ5H8A4 983 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.615e-7■■■□□ 15.7
CAPNS1-204ENST00000587718 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 MED16Q9Y2X0 877 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM233B4DJY2 109 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRT4C9JH25 899 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SOCS5O75159 536 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PIRTP0C851 137 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SESN3P58005 492 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CREB5Q02930 508 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG1Q06432 222 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRCAPQ14761 206 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT3A2Q3SY77 523 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 DHDDSQ86SQ9 333 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CARNMT1Q8N4J0 409 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RLN3Q8WXF3 142 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 RCN3Q96D15 328 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT7Q99832 543 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 WASF2Q9Y6W5 498 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-204ENST00000587718 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 BUD23O43709 281 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX1O43933 1283 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PDHA1P08559 390 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MC4RP32245 332 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGCLP35914 325 aa25.07■■□□□ 1.6
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