RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587260.1

NFIX-208, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-208ENST00000587260 ZNF460Q14592 562 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TCEA2Q15560 299 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PIM3Q86V86 326 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CD200R1Q8TD46 325 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 INPP5DQ92835 1189 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPR78Q96P69 363 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPR27Q9NS67 375 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SUFUQ9UMX1 484 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPR34Q9UPC5 381 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DMDP11532 3685 aa14.68□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 A0A1B0GTW7 788 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PRSS38A1L453 326 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 E5RI56 91 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NUAK1O60285 661 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 MAGEC1O60732 1142 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DNAJC6O75061 913 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPR89BP0CG08 455 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GNPDA1P46926 289 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PRLHRP49683 370 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 C21orf59P57076 290 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 IRF9Q00978 393 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PTK2BQ14289 1009 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FZD2Q14332 565 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 BCL7AQ4VC05 210 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GALPQ9UBC7 116 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RAB23Q9ULC3 237 aa14.67□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 A0A1B0GVT2 93 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCDC189A1A4V9 331 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TLR4O00206 839 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CHUKO15111 745 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 KPNA5O15131 536 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GRID2O43424 1007 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TRIM16O95361 564 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FUCA1P04066 466 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GSTM1P09488 218 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCDC166P0CW27 439 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CHN1P15882 459 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ATP1A2P50993 1020 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NXPH1P58417 271 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GSTM4Q03013 218 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DLG1Q12959 904 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TEAD4Q15561 434 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ALG11Q2TAA5 492 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCDC153Q494R4 210 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 IQCHQ86VS3 1027 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PARGQ86W56 976 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SYT12Q8IV01 421 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 MDM1Q8TC05 714 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SLC30A3Q99726 388 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PRRX2Q99811 253 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms