RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 STYXQ8WUJ0 223 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NAT14Q8WUY8 206 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ART4Q93070 314 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ULK4Q96C45 1275 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR9Q96RI9 348 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 COPS8Q99627 209 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PRORYQ9H606 182 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 POT1Q9NUX5 634 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SMOXQ9NWM0 555 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KALRNO60229 2985 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LILRA5A6NI73 299 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf172C9J069 976 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LDB2O43679 373 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CEP104O60308 925 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FGGP02679 453 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LIPCP11150 499 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ETS1P14921 441 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 BRAFP15056 766 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CD82P27701 267 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CXCR5P32302 372 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FDFT1P37268 417 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ATRXP46100 2492 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SEPHS1P49903 392 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 XIAPP98170 497 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CDH17Q12864 832 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPR18Q14330 331 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PLCL1Q15111 1095 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPR33Q49SQ1 333 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC38Q502W7 563 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MANEAQ5SRI9 462 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IRGCQ6NXR0 463 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF449Q6P9G9 518 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NXPE1Q8N323 547 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TGM7Q96PF1 710 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 WWP1Q9H0M0 922 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 UCK1Q9HA47 277 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PAK5Q9P286 719 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 HEATR9A2RTY3 570 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL33A6NCF5 533 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT4DA6NG13 374 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 B4E171 279 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 STMND1H3BQB6 276 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 APRTP07741 180 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN7P41732 249 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1A2P50993 1020 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RAB15P59190 212 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCZ1BP86790 482 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CACNG1Q06432 222 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FOXM1Q08050 763 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DMPKQ09013 629 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LAMB3Q13751 1172 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RPE65Q16518 533 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms