RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 ABI3Q9P2A4 366 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CHUKO15111 745 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZNF749O43361 778 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 UMODP07911 640 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PDHA1P08559 390 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 HTR7P34969 479 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PREPP48147 710 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PNOCQ13519 176 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 STIM1Q13586 685 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DSG2Q14126 1118 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PCOLCEQ15113 449 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 C8orf34Q49A92 452 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 TAF3Q5VWG9 929 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CES4AQ5XG92 561 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 GPR150Q8NGU9 434 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 NACC2Q96BF6 587 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PPM1MQ96MI6 270 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZNF599Q96NL3 588 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 SMIM14Q96QK8 99 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CBX8Q9HC52 389 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FZD10Q9ULW2 581 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 MEMO1Q9Y316 297 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 A0A0J9YYE9 177 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DYTNA2CJ06 578 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PMPCBO75439 489 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZNF202O95125 648 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 RASAL1O95294 804 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CLDN7O95471 211 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 GNA14O95837 355 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 F13A1P00488 732 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 TRBC1P01850 177 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CBSLP0DN79 551 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 VCLP18206 1134 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CDH3P22223 829 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 IL4RP24394 825 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CBSP35520 551 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 SPINT3P49223 89 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 EPHB1P54762 984 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 AIF1P55008 147 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FOXL2P58012 376 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ADAM8P78325 824 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 NAA35Q5VZE5 725 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 BBS5Q8N3I7 341 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PGBD5Q8N414 524 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 MAGED4Q96JG8 741 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 C18orf12Q96KH6 178 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 GSDMAQ96QA5 445 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 MGME1Q9BQP7 344 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 OR6C74A6NCV1 312 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 DAPK3O43293 454 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 MAP3K7O43318 606 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 FZD6O60353 706 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 KLHL18O94889 574 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZWINTO95229 277 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 HEXAP06865 529 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 INHBBP09529 407 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 MSL3P1P0C860 447 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 IGFBP2P18065 325 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-212ENST00000582376 GPD1P21695 349 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms