RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575322.1

AKAP1-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene AKAP1, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-216ENST00000575322 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 ARL5BQ96KC2 179 aa6.69□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 EXOC2Q96KP1 924 aa6.69□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 APOLD1Q96LR9 279 aa6.69□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 CCDC138Q96M89 665 aa6.69□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 LYSMD1Q96S90 227 aa6.69□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.69□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.69□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.68□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 TSHRP16473 764 aa6.68□□□□□ -1.34
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AKAP1-216ENST00000575322 APOOQ9BUR5 198 aa6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 CDH19Q9H159 772 aa6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 IFT22Q9H7X7 185 aa6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
AKAP1-216ENST00000575322 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.68□□□□□ -1.34
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