RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEX13Q92968 403 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANBP9Q96S59 729 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 JRKLQ9Y4A0 524 aa16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf172C9J069 976 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP3B1O00203 1094 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9P02748 559 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL4P13236 92 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMD1P17707 334 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPSTP25325 297 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACRV1P26436 265 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPZBP47756 277 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXADRP78310 365 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR18Q14330 331 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFE2L1Q14494 772 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPE65Q16518 533 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL35Q6PF15 583 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 HM13Q8TCT9 377 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB33BQ9H082 229 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.75■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 STMND1H3BQB6 276 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 QSOX1O00391 747 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGTAO43765 313 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP104O60308 925 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP2A2O94973 939 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 APRTP07741 180 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADRA1DP25100 572 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 VAC14Q08AM6 782 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM129CQ86XR2 697 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMPERQ8N8U9 685 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ART4Q93070 314 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf72Q96LT7 481 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZPBPQ9BS86 351 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASS4Q9NQ75 786 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 OGFRQ9NZT2 677 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.74■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB7A8K855 629 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL22O00626 93 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN12O43309 604 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFS1P28331 727 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK16Q00536 496 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 MC2RQ01718 297 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITIH4Q14624 930 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PACS1Q6VY07 963 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 DTX1Q86Y01 620 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGSM3Q96HU1 749 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PBKQ96KB5 322 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC1Q99614 292 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.73■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 A8MU76 341 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 F8W8V4 182 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7ENP7 123 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGRPO00253 132 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETS1P14921 441 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TYRP1P17643 537 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCR5P32302 372 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSG1P42857 185 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHDQ02161 417 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACVR1Q04771 509 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPA4Q13156 261 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.72■□□□□ 0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms