RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	RASA4B	C9J798	803 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC16A5	O15375	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CCL16	O15467	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	RASA4	O43374	803 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	GRID2	O43424	1007 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	RPA1	P27694	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	AVPR1A	P37288	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	BRCC3	P46736	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CLCN5	P51795	746 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CLCNKB	P51801	687 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	PSMD5	Q16401	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	MUL1	Q969V5	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS11-208	ENST00000559557	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		E9PMD0	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ACKR2	O00590	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNJ13	O60928	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	VNN2	O95498	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PEPD	P12955	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LAMP2	P13473	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CEBPB	P17676	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CYP11B2	P19099	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FCAR	P24071	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CCR2	P41597	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NAMPT	P43490	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HSPA7	P48741	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	UPP1	Q16831	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLK5	Q496M5	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		Q6ZSV7	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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