RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545210.5

TMEM258-208, Transcript of transmembrane protein 258, human

TSL 3

Gene TMEM258, Length 579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM258-208	ENST00000545210	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	KCNK1	O00180	336 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61	2e-32	■■■■□ 22.8
TMEM258-208	ENST00000545210	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	MYBL1	P10243	752 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	RORA	P35398	523 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	ASIC2	Q16515	512 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM258-208	ENST00000545210	SEC16A	O15027	2179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	LRRTM2	O43300	516 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	OTX2	P32243	289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CA5A	P35218	305 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	GJC1	P36383	396 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	GLRB	P48167	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	GBE1	Q04446	702 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	NCF4	Q15080	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	PCSK7	Q16549	785 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	POLE	Q07864	2286 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	AURKA	O14965	403 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ALPP	P05187	535 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CYP2A7	P20853	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ARSE	P51690	589 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CTSC	P53634	463 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	MYL5	Q02045	173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	DMPK	Q09013	629 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	XRCC4	Q13426	336 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	RAB43	Q86YS6	212 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM258-208	ENST00000545210	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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