RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538573.1

LINC02408-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2408, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC02408, Length 559 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02408-202ENST00000538573 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TPP1O14773 563 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RAD51BO15315 384 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SPAG7O75391 227 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MTX2O75431 263 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RFPL1O75677 317 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RHOBTB1O94844 696 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TRIM16O95361 564 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ASMTLO95671 621 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 IGLV3-19P01714 112 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PYGLP06737 847 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RALBP11234 206 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 STMN1P16949 149 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ITGB6P18564 788 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KRT4P19013 534 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 AOC1P19801 751 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CHRM3P20309 590 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HPDP32754 393 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 NSG1P42857 185 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 POLD2P49005 469 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SERPINB8P50452 374 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PGGT1BP53609 377 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TAS2R39P59534 338 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PPP2CBP62714 309 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PPP2CAP67775 309 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 POU4F1Q01851 419 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CREB5Q02930 508 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DPTQ07507 201 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DNAJC3Q13217 504 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FGL2Q14314 439 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ITIH4Q14624 930 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 INPP5AQ14642 412 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 IRF4Q15306 451 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PPM1JQ5JR12 505 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PNCKQ6P2M8 343 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TSSK4Q6SA08 328 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RAPH1Q70E73 1250 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DET1Q7L5Y6 550 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GALNT7Q86SF2 657 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TRIM74Q86UV6 250 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TRABD2AQ86V40 505 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TRIM69Q86WT6 500 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TREML1Q86YW5 311 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RBFAQ8N0V3 343 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KRT222Q8N1A0 295 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PELI3Q8N2H9 469 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DEFB119Q8N690 84 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CLDN19Q8N6F1 224 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MZB1Q8WU39 189 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 NAT14Q8WUY8 206 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SNX19Q92543 992 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LPGAT1Q92604 370 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GLYATL1Q969I3 302 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CENPTQ96BT3 561 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM136AQ96C01 138 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TLCD1Q96CP7 247 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SGF29Q96ES7 293 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HIC2Q96JB3 615 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SERAC1Q96JX3 654 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SPACA7Q96KW9 195 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 VPS35Q96QK1 796 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SMC6Q96SB8 1091 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GPR22Q99680 433 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MYOCQ99972 504 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 BOCQ9BWV1 1114 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 VPS11Q9H270 941 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.12□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms