RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520991.3

CLN8-205, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-205ENST00000520991 ALG3Q92685 438 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CATSPER2Q96P56 530 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 AMFRQ9UKV5 643 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KCTD3Q9Y597 815 aa15.5■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 DLGAP3O95886 979 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 RALBP11234 206 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 STAT5AP42229 794 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 IL11RAQ14626 422 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PEX26Q7Z412 305 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ULK4Q96C45 1275 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 RNF31Q96EP0 1072 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 RAB33BQ9H082 229 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 STARD5Q9NSY2 213 aa15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KLHL33A6NCF5 533 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 MGAT4DA6NG13 374 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ITGB6P18564 788 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ITGALP20701 1170 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 HADHAP40939 763 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CCR10P46092 362 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PPP1CAP62136 330 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TMPRSS15P98073 1019 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 MC1RQ01726 317 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 MAP7Q14244 749 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SPARCL1Q14515 664 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 METRNLQ641Q3 311 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TTC13Q8NBP0 860 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 OR2L2Q8NH16 312 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 NAT14Q8WUY8 206 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 STARD8Q92502 1023 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 C12orf66Q96MD2 445 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 WWP1Q9H0M0 922 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 IL17BQ9UHF5 180 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TENM4Q6N022 2769 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 BSNQ9UPA5 3926 aa15.48■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CFAP99D6REC4 459 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 NKX2-8O15522 239 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ZNF28P17035 718 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ARL4DP49703 201 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 POLE2P56282 527 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 NFKB2Q00653 900 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 CDC20Q12834 499 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KIF5AQ12840 1032 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 GSE1Q14687 1217 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 BCL7AQ4VC05 210 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 UBXN4Q92575 508 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KIAA0754O94854 1291 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 FTCDO95954 541 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TCN2P20062 427 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 XIAPP98170 497 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KCNAB2Q13303 367 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 TUBB3Q13509 450 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 KRT33BQ14525 404 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 C16orf46Q6P387 395 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 SNX20Q7Z614 316 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 OOSP2Q86WS3 158 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 NXPE1Q8N323 547 aa15.46■□□□□ 0.07
CLN8-205ENST00000520991 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms