RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520580.5

SREK1-208, Transcript of splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1, human

TSL 2

Gene SREK1, Length 2,369 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREK1-208	ENST00000520580	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580		H7C1Q1	480 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CLDN4	O14493	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	PLSCR1	O15162	318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	NDUFS4	O43181	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RIPK2	O43353	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FCGR3B	O75015	233 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MT-ATP6	P00846	226 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	LCAT	P04180	440 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CCDC192	P0DO97	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	IL10	P22301	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	HRH2	P25021	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SFN	P31947	248 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CHRNA3	P32297	505 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MAGEB1	P43366	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RAP1GAP	P47736	663 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CD81	P60033	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	PRKCE	Q02156	737 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CEBPE	Q15744	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TMEM18	Q96B42	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FEV	Q99581	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SPG21	Q9NZD8	308 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FZD1	Q9UP38	647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MGST3	O14880	152 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	T	O15178	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF217	O75362	1048 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MOSPD3	O75425	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	DIRAS3	O95661	229 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	PLA2G4B	P0C869	781 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CD22	P20273	847 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	HOXC9	P31274	260 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CDK3	Q00526	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TNK1	Q13470	666 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MELK	Q14680	651 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	C12orf60	Q5U649	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RAD54L	Q92698	747 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	RND1	Q92730	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	OR6C1	Q96RD1	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SEPHS2	Q99611	448 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	GFI1	Q99684	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SEMA3C	Q99985	751 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	HAUS8	Q9BT25	410 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	DPP3	Q9NY33	737 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MAST3	O60307	1309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	STMND1	H3BQB6	276 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	GLCE	O94923	617 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF202	O95125	648 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	PGLS	O95336	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	SERPING1	P05155	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	MAPK12	P53778	367 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	CFHR1	Q03591	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	GAD2	Q05329	585 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ZNF124	Q15973	351 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	GPSM1	Q86YR5	675 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SREK1-208	ENST00000520580	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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