RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	INSC	Q1MX18	579 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652		H3BQF6	201 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	VILL	O15195	856 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GLRA3	O75311	464 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	KLHL2	O95198	593 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CREB1	P16220	341 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	C21orf59	P57076	290 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	IRF9	Q00978	393 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PPARD	Q03181	441 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CSHL1	Q14406	222 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	KLC3	Q6P597	504 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HID1	Q8IV36	788 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MKS1	Q9NXB0	559 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652		A0A1B0GTW7	788 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	GPC4	O75487	556 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	RASGRP1	O95267	797 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	WNT1	P04628	370 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DPP6	P42658	865 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	BLK	P51451	505 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	FZD2	Q14332	565 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	OXR1	Q8N573	874 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SCYL1	Q96KG9	808 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	BPTF	Q12830	3046 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TMA16-205	ENST00000508652	TYROBP	O43914	113 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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