RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 RDH14Q9HBH5 336 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 ELOVL2Q9NXB9 296 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 CD274Q9NZQ7 290 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 OARD1Q9Y530 152 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FBP2O00757 339 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD51BO15315 384 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FFAR2O15552 330 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX2O60749 519 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FKBP6O75344 327 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM16O95361 564 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 STX5Q13190 355 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 GRB7Q14451 532 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 AGKQ53H12 422 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF805Q5CZA5 627 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGGQ5H8A4 983 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 GK5Q6ZS86 529 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 DPPA4Q7L190 304 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 HPS6Q86YV9 775 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 NRG4Q8WWG1 115 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 DLG3Q92796 817 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 ESAMQ96AP7 390 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 MTG2Q9H4K7 406 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 NDE1Q9NXR1 346 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 STOML1Q9UBI4 398 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 SUN2Q9UH99 717 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 POLG2Q9UHN1 485 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR7A17O14581 309 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6AP2O75787 350 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 MATN4O95460 622 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-209ENST00000504450 GRIK2Q13002 908 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 CEACAM7Q14002 265 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 PHKG1Q16816 387 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL9Q3SXZ7 439 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 CMPK2Q5EBM0 449 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-209ENST00000504450 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
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