RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	POLB	P06746	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	HGF	P14210	728 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TYRP1	P17643	537 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MPST	P25325	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC19A1	P41440	591 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN7	P41732	249 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PRLHR	P49683	370 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PDX1	P52945	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSC	P53634	463 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RPA4	Q13156	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR10	Q9BXR5	811 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	EML2	O95834	649 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RPN2	P04844	631 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ITIH1	P19827	911 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPZB	P47756	277 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CD151	P48509	253 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TTPA	P49638	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	XIAP	P98170	497 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TLE3	Q04726	772 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXM1	Q08050	763 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR18	Q14330	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TMED2	Q15363	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RPE65	Q16518	533 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN4	Q92575	508 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CD180	Q99467	661 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CASS4	Q9NQ75	786 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	APC2	O95996	2303 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CES2	O00748	559 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	KPNA5	O15131	536 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR39	O43194	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF10	O60809	474 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFS3	O75489	264 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT14	P02533	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ETS1	P14921	441 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TPSB2	P20231	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ITPKB	P27987	946 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PAFAH1B1	P43034	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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