RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TIMP4	Q99727	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	VPS18	Q9P253	973 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TECTA	O75443	2155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293		M0QYT0	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	IRAK2	O43187	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TIMM44	O43615	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PEX1	O43933	1283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ACSL4	O60488	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TULP3	O75386	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GRAP2	O75791	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MOCS3	O95396	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EGF	P01133	1207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	GYPC	P04921	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CALB1	P05937	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CHRM2	P08172	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TYR	P14679	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCR1	P32246	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MATK	P42679	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CCT5	P48643	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRIM2	P49643	509 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PGF	P49763	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	SULT1E1	P49888	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	HK3	P52790	923 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KDSR	Q06136	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MTAP	Q13126	283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NME3	Q13232	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-240	ENST00000495293	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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