RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RAPH1Q70E73 1250 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZBTB2Q8N680 514 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GAREM1Q9H706 876 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KLC4Q9NSK0 619 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TLK1Q9UKI8 766 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PSAT1Q9Y617 370 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TMEM131Q92545 1883 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GTQ1 180 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ENGP17813 658 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KRT15P19012 456 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SAT1P21673 171 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CASP8Q14790 479 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CSRP2Q16527 193 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HLA-BQ31612 363 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KRT71Q3SY84 523 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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ACTB-213ENST00000493945 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LMX1AQ8TE12 382 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 INPP5DQ92835 1189 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 BIRC8Q96P09 236 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 NDNQ99608 321 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 COG4Q9H9E3 785 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 A0A087X1B8 175 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SMIM23A6NLE4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZW10O43264 779 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 NIPSNAP2O75323 286 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PIAS2O75928 621 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 FDXRP22570 491 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TYK2P29597 1187 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RAB10P61026 200 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MROH9Q5TGP6 573 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KLC3Q6P597 504 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TTC23LQ6PF05 361 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LRRC61Q9BV99 259 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GPAMQ9HCL2 828 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SENP1Q9P0U3 644 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DHRS7Q9Y394 339 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTB-213ENST00000493945 LMO7DNF2Z398 122 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 DYNC1I1O14576 645 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 TPP1O14773 563 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 PCDHGA12O60330 932 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 C1QAP02745 245 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 MPOP05164 745 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ITGB6P18564 788 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 AOAHP28039 575 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 NDUFS1P28331 727 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC26A3P40879 764 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 RPIAP49247 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 IL2P60568 153 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CTBSQ01459 385 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 GPS2Q13227 327 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 SLC14A1Q13336 389 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-213ENST00000493945 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.64□□□□□ -0.07
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