RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 LRCH3Q96II8 777 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MID1IP1Q9NPA3 183 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ARMCX1Q9P291 453 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HAO1Q9UJM8 370 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 PRR23AA6NEV1 266 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 IGLON5A6NGN9 336 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM233B4DJY2 109 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 K7ESM1 405 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF195O14628 629 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 STX16O14662 325 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 FFAR2O15552 330 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CRCPO75575 148 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SERPINA6P08185 405 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 VCLP18206 1134 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RASSF2P50749 326 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 NAA20P61599 178 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CLCQ05315 142 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 DPTQ07507 201 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 GTF2H3Q13889 308 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 AGBL4Q5VU57 503 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 NXNQ6DKJ4 435 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SBSNQ6UWP8 590 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 FAR2Q96K12 515 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CDYLQ9Y232 598 aa8.66□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 E9PBE3 544 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 KLHL41O60662 606 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 UNC5CO95185 931 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CBX6O95503 412 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HIST1H2ADP20671 130 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 EPHA3P29320 983 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RGS19P49795 217 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 AGTR2P50052 363 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HK3P52790 923 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RBBP7Q16576 425 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM74Q86UV6 250 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 PELI3Q8N2H9 469 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MAPK15Q8TD08 544 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ESAMQ96AP7 390 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM159Q96B96 161 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 GABRG3Q99928 467 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 HGH1Q9BTY7 390 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 OR2AG1Q9H205 316 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 FBRSQ9HAH7 460 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SAR1AQ9NR31 198 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 OARD1Q9Y530 152 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TRIOO75962 3097 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 NUMA1Q14980 2115 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 GRID2O43424 1007 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 AP1G1O43747 822 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 KLK8O60259 260 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MLYCDO95822 493 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SOD1P00441 154 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 RPIAP49247 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 COPAP53621 1224 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TAS2R38P59533 333 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 SH3BP2P78314 561 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 CREB5Q02930 508 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 LCP2Q13094 533 aa8.65□□□□□ -1.02
SNHG16-202ENST00000493536 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms