RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 GABRB2P47870 512 aa2.3□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 P2RY6Q15077 328 aa2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 NAA35Q5VZE5 725 aa2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.3□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.3□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 HARBI1Q96MB7 349 aa2.3□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 PP632Q6XCG6 107 aa2.29□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 SARDHQ9UL12 918 aa2.28□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.28□□□□□ -2.04
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SENP6-210ENST00000487548 YIPF1Q9Y548 306 aa2.28□□□□□ -2.04
SENP6-210ENST00000487548 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 TTC36A6NLP5 189 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 LRRC53A6NM62 1247 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 F9P00740 461 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 ABCD3P28288 659 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 CPOXP36551 454 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 MAPK9P45984 424 aa2.27□□□□□ -2.05
SENP6-210ENST00000487548 BIRC3Q13489 604 aa2.27□□□□□ -2.05
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