RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485060.1

PIK3CB-211, Transcript of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PIK3CB, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3CB-211	ENST00000485060	PTPRC	P08575	1304 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIK3CB-211	ENST00000485060	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIK3CB-211	ENST00000485060	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060		H0YIN7	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SLC16A5	O15375	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	VPREB1	P12018	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ITGA2	P17301	1181 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GJA1	P17302	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CYP11B2	P19099	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	COG2	Q14746	738 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TANK	Q92844	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	IL25	Q9H293	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RFPL2	O75678	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GCNT3	O95395	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PGGT1B	P53609	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TWIST1	Q15672	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	XRCC3	O43542	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GLUD1	P00367	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	QDPR	P09417	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	HOXC6	P09630	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PFKFB1	P16118	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PTAFR	P25105	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GLUD2	P49448	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PIGT	Q969N2	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TAF1	P21675	1872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	SSX4	O60224	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIK3CB-211	ENST00000485060	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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