RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ASB7	Q9H672	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP34-215	ENST00000484179	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		H0Y626	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OGT	O15294	1046 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TULP3	O75386	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KCNK5	O95279	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TRIM16	O95361	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SEC24A	O95486	1093 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	METTL18	O95568	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PROS1	P07225	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CSH1	P0DML2	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CSH2	P0DML3	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CEACAM1	P13688	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ARSA	P15289	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GABRR2	P28476	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HOXD12	P35452	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CCR2	P41597	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PPP3CC	P48454	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LIG4	P49917	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MVD	P53602	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OSTN	P61366	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RUNX3	Q13761	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BICD1	Q96G01	975 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	AK8	Q96MA6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GPR78	Q96P69	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TRIO	O75962	3097 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		A6NCN8	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		I3L4J1	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EXOC3	O60645	756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MOSPD3	O75425	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NFATC1	O95644	943 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	APBB3	O95704	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CAVIN2	O95810	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	BMP15	O95972	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PIGR	P01833	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ADRB2	P07550	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	3e-7	■□□□□ 9.9
USP34-215	ENST00000484179	CDC25A	P30304	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GPD2	P43304	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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