RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468872.5

LSM5-209, Transcript of LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated, human

TSL 2

Gene LSM5, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSM5-209	ENST00000468872	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	MYOD1	P15172	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CTSC	P53634	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CD81	P60033	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	MELK	Q14680	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PIGT	Q969N2	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SLC16A5	O15375	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	WISP2	O76076	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PMS2P2	O95744	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PDLIM4	P50479	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ROR1	Q01973	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	DLG1	Q12959	904 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	OLFM1	Q99784	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	EVPL	Q92817	2033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	QDPR	P09417	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FCGR1A	P12314	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GABRA5	P31644	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PEX5	P50542	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	DSCR9	P59020	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ISL1	P61371	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TROAP	Q12815	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	RALGDS	Q12967	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872		Q6ZTC4	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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