RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF197O14709 1029 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AREL1O15033 823 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD28O15084 1053 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UBDO15205 165 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PFDN6O15212 129 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP6O75344 327 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KRT34O76011 436 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SOD1P00441 154 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASLP04424 464 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT2B4P06133 528 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CA3P07451 260 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CBSLP0DN79 551 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UROSP10746 265 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF30P17039 623 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AOAHP28039 575 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 VIPR1P32241 457 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CCR7P32248 378 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CBSP35520 551 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NSG1P42857 185 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A12P48065 614 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDKL1Q00532 357 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC34A1Q06495 639 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH1Q08174 1060 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FOXC1Q12948 553 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CUL3Q13618 768 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GRB7Q14451 532 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 E2F5Q15329 346 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FXNQ16595 210 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 COQ5Q5HYK3 327 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GK5Q6ZS86 529 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSR9 355 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 USP45Q70EL2 814 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RETREG3Q86VR2 466 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP8Q86W28 1048 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPSM1Q86YR5 675 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HPS6Q86YV9 775 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DDHD1Q8NEL9 900 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GDPD5Q8WTR4 605 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TSPEARQ8WU66 669 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NAT14Q8WUY8 206 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NXPE3Q969Y0 559 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ULK4Q96C45 1275 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 COQ10AQ96MF6 247 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASB16Q96NS5 453 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HHIPQ96QV1 700 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CIPCQ9C0C6 399 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CLPBQ9H078 707 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ACTL8Q9H568 366 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASB8Q9H765 288 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 S100A14Q9HCY8 104 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HPS4Q9NQG7 708 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AIG1Q9NVV5 245 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OBP2AQ9NY56 170 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MAP10Q9P2G4 905 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP2Q9UG22 337 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 POLG2Q9UHN1 485 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A13Q9UJS0 675 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SERTM1A2A2V5 107 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EPOPA6NHQ4 379 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRRT4C9JH25 899 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GFYI3L273 518 aa5.55□□□□□ -1.52
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