RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, human

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNN3-204	ENST00000461018	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NAGS	Q8N159	534 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	STARD8	Q92502	1023 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NRGN	Q92686	78 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NINJ1	Q92982	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MED15	Q96RN5	788 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MIS12	Q9H081	205 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CDH19	Q9H159	772 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TULP2	O00295	520 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ACSL4	O60488	711 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	F9	P00740	461 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	IL1B	P01584	269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TPM2	P07951	284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	KRT5	P13647	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TSHR	P16473	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TCN2	P20062	427 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	KLK2	P20151	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CD40	P25942	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CD82	P27701	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	HDAC4	P56524	1084 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	IL2	P60568	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	LRMP	Q12912	555 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FHL2	Q14192	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CAMK4	Q16566	473 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ARC	Q7LC44	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	KAT5	Q92993	513 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ART4	Q93070	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	CTRC	Q99895	268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CNN3-204	ENST00000461018	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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