RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 USP30Q70CQ3 517 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ELMO1Q92556 727 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ESAMQ96AP7 390 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 HIC2Q96JB3 615 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 FZD4Q9ULV1 537 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 A8MT66 165 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PREPP48147 710 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 STX3Q13277 289 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 KBTBD6Q86V97 674 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SCML1Q9UN30 329 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 FRYLO94915 3013 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 POM121BA6NF01 834 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM13O60858 407 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 FUCA1P04066 466 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 RBP1P09455 135 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPAN8P19075 237 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 IGFALSP35858 605 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LCA5Q86VQ0 697 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 AGR3Q8TD06 166 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1191Q96A73 305 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF112Q9ULX5 631 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CHRNGP07510 517 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC32Q14392 662 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PFKFB4Q16877 469 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 NLRP8Q86W28 1048 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 GJD3Q8N144 294 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB119Q8N690 84 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 COX14Q96I36 57 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SHDQ96IW2 340 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM237Q96Q45 408 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PANX3Q96QZ0 392 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CDYLQ9Y232 598 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LILRB5O75023 590 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 APOA4P06727 396 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PDHA2P29803 388 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC1A6P48664 564 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MNAT1P51948 309 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MTAPQ13126 283 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SUPT3HO75486 399 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 OCRLQ01968 901 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TCEA2Q15560 299 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PHKG1Q16816 387 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LIPMQ5VYY2 423 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SORT1Q99523 831 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PREBQ9HCU5 417 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 NPHS2Q9NP85 383 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ASB1Q9Y576 335 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TTC28Q96AY4 2481 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SERPINE1P05121 402 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PRLHRP49683 370 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 AGTR2P50052 363 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SBSNQ6UWP8 590 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PJA1Q8NG27 643 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ASB2Q96Q27 587 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 H0YHG0 523 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 LATO43561 262 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PI15O43692 258 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms