RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IL31RAQ8NI17 732 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ROPN1LQ96C74 230 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF639Q9UID6 485 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YYE9 177 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 H0Y626 953 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA3DO95025 777 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNE2O96020 404 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PDGFRAP16234 1089 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2A7P20853 494 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GGT5P36269 586 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT1P36639 197 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DDOSTP39656 456 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFA1P59665 94 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFA3P59666 94 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PLIN5Q00G26 463 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF3Q13114 568 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKZQ13574 1117 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GRM3Q14832 879 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC14Q49A88 953 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RABL3Q5HYI8 236 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RDH11Q8TC12 318 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 STYXQ8WUJ0 223 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 YIPF6Q96EC8 236 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS2Q9BXC9 721 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 POMKQ9H5K3 350 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NTN4Q9HB63 628 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AASSQ9UDR5 926 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LACTBL1A8MY62 500 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 J3KRW8 73 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD1O00168 92 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPT2O15123 496 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HUS1O60921 280 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 YES1P07947 543 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MLNP12872 115 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GPD1P21695 349 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CD9P21926 228 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A2P23975 617 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IL32P24001 234 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2F1P24903 491 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B2P37059 387 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GSK3BP49841 420 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RAC1P63000 192 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EPS8Q12929 822 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL7AQ4VC05 210 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC23Q5W5X9 447 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NOXA1Q86UR1 476 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HORMAD1Q86X24 394 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC9Q92623 222 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF170Q96K19 258 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms