RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AGBL2Q5U5Z8 902 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL27RAQ6UWB1 636 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT222Q8N1A0 295 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2L2Q8NH16 312 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INPP5DQ92835 1189 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDXPQ96GD0 296 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOPNLQ96NB1 174 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPS11Q9H270 941 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MED4Q9NPJ6 270 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PILRBQ9UKJ0 227 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACOT9Q9Y305 439 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 R4GN57 208 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa10.09□□□□□ -0.79
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BPTFQ12830 3046 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CEP192Q8TEP8 1941 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A096LPK6 155 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GVT2 93 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IQCF5A8MTL0 148 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COPEO14579 308 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 YKT6O15498 198 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SASH3O75995 380 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYPP08247 313 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC2A4P14672 509 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 JUNDP17535 347 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRT4P19013 534 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC26A3P40879 764 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HALP42357 657 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCT5P48643 541 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HK3P52790 923 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDKN2DP55273 166 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS2R39P59534 338 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP8P85298 464 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSPA14Q0VDF9 509 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPA4Q13156 261 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FZD2Q14332 565 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOCQ15369 112 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LPAL2Q16609 132 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALG11Q2TAA5 492 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PYCR3Q53H96 274 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AGAP9Q5VTM2 703 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAYNQ6UX15 382 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CMC1Q7Z7K0 106 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIM3Q86V86 326 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCA5Q86VQ0 697 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD200R1Q8TD46 325 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLMNQ92990 594 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ISL2Q96A47 359 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OLFM1Q99784 485 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNH6Q9H252 994 aa10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms